周瑜屯兵巴丘，加紧训练军队，演兵场上，洞庭湖中，军容威武齐整，战船风帆高悬。
鲁肃受孙权指派，前来检阅和慰劳大军。周瑜在洞庭湖边建好了阅军楼（现在的岳阳楼），东吴三军整装列阵，接受正、副都督的检阅。
阅军楼上旌旗飘扬，楼下战鼓咚咚，号炮隆隆。演兵场上步兵戎装列队，刀枪剑戟，光芒四射；洞庭湖中，千艘战船，扬帆待航。
周瑜、鲁肃和诸位将领登上阅军楼。周瑜身披战袍，头戴银盔，腰佩越王剑，手持蛇鞭，大步走到阅军楼正中，朗声说道：“奉主公之命，我东吴大军出征西川，消灭刘璋，根除后患，确保东吴后方平安。得西川，东吴安！”
此时，楼上、楼下齐声高呼：“得西川，东吴安！”
“得西川，东吴安！”
检阅完毕，周瑜拉着鲁肃的手回到营帐，设宴为鲁肃接风洗尘，众将官入席作陪。
席间，鲁肃对周瑜说道：“我奉主公之命，此次来巴丘，一是慰问三军，二是向大都督通报朝中事务……”
周瑜打断了鲁肃的话，说道：“子敬糊涂啊！你不该同意主公放走了刘备，这是在养虎为患那！”
鲁肃说道：“你有你的道理，主公有主公的考虑。朝中群臣意见分歧也很严重。我是主张巩固孙、刘联盟，放刘备回荆州的。你我虽然政见不同，但都是在为主公着想，为东吴基业谋划呀。绝无半点私心！”
“我对子敬的忠心丝毫都不怀疑。我也是为主公，为东吴的宏图大业着想啊。”
周瑜向鲁肃深入分析，说道：“我们要深入地看到孙、刘联盟的利和弊。赤壁之战，刘备派兵协助我们联合抗曹，取得了战役上的胜利，刘备借此也占据了南郡。刘备外表看上去忠厚老实，与世无争，其实是内心野心勃勃，他处处以皇室之胄自居。以前是到处漂泊流浪，现在主公借给他荆州。刘备以此为根基，又攻占了长沙四郡，有了地盘，又有了势力，加上了关羽、张飞、赵云三位猛将，又有诸葛亮为其出谋划策，前途不可估量啊！”
停了停，周瑜接着说道：“这个世界上，没有永久的敌人，也没有永久的朋友。利益是最大的联盟。赤壁之战之前，袁绍被灭之后，就形成了孙、曹隔江对峙的局面；赤壁之战之后，就加进了一个刘备。曹操现在退到了北方，和我们隔江而望，中间又有荆州之地作为缓冲，暂时与我东吴没有太大的冲突；刘备夹在中间，他不可能北进同曹操争地盘，最大的可能是向西发展，这就和我们的战略格局相冲突。刘备嵌在东吴到西川之间，是我们西征的最大障碍。我们要取川蜀，刘备、诸葛亮就不想取？依我看，孙、刘联盟为时不长！刘备一旦羽毛丰满，就会跟我们分道扬镳，甚至会反目成仇。”
鲁肃静静地听着周瑜的分析，似乎也意识到了什么。鲁肃敬佩地说道：“公瑾为东吴、为主公真是殚精竭虑啊！”
宴席散后，周瑜拉着鲁肃的手，来到自己的营帐。士兵为他们备好了茶水后就退了出来。
周瑜和鲁肃并榻而坐，周瑜显得有些疲惫。鲁肃说道：“公瑾南征北战，戎马劳顿，要注意身体呀。看你气色不好，身体无恙吧？”
周瑜听鲁肃问起自己的身体，就说：“偶遇风寒，稍感不适，并无大碍。子敬，不瞒你说，这次我是带着箭伤出征的，时不我待啊。”
周瑜喘息了一下，接着说道：“这段时间，经常是头疼的厉害，夜间也睡不好觉。恐怕是老毛病要犯了。”
鲁肃听了，担心地问道：“公瑾有老毛病？没有根治吗？”
“是二十年前的老毛病了。”周瑜说道：“当时是请了太医柳仝治的，吃了他自制的药丸就好了。一直都没有再犯。”
“哦。可是柳仝早已不在人世了，现在有谁能治啊？”鲁肃遗憾地说道。
“不妨。柳仝当年做了两颗药丸，说：‘此药只有我会制，现在吃了一粒，剩下的一粒要妥善保管，以备后用。’”
“药带在身边吗？”鲁肃忙问。
“在小乔那里。”周瑜说。
“那赶快派人去取啊。”
周瑜摆摆手说：“不用了。我想回京师一趟，当面和主公交换意见。”
周瑜继续对鲁肃说道：“子敬啊，你遇事冷静，有自己的主见，也深得主公的信任。以后要多挑重担啊。”
鲁肃忙说：“公瑾，你是我东吴的中流砥柱，除了主公，没有人能与你相提并论。承蒙你举荐，我才能为主公效力。我永远都是你的副手。“
周瑜拍拍鲁肃的肩头，说道：“我们同心协力吧。”
再说诸葛亮已经识破了周瑜西征的正真意图，已派刘封、关平带领大军堵住了周瑜的去路，并派人给周瑜送来了一封信。
信中说道：“我听说大都督欲取西川，特致信劝阻：西川地势险要，民风强悍；刘璋虽然昏庸懦弱，但还是有力量和你抗衡的。大都督劳师远征，跋涉千万里，事态恐有不测！再说曹操兵败赤壁，无时无刻也没有忘记报仇雪恨。你出兵远征，倘若曹操趁虚而入，江东岂不危在旦夕？还望大都督三思而行！”
周瑜看了诸葛亮的信，知道他这是在威胁自己。曹操不忘雪耻，正时刻虎视眈眈地窥视着江东的一举一动，这倒是事实。统观眼下时局，还不是孙、刘联盟闹翻的时候。南郡还是暂时让他们代守吧。
周瑜陷入了进退两难的困境，也陷入了极度苦恼的境地。自己借出兵西川而攻取南郡的意图已被诸葛亮识破，大军受阻于巴丘。孙权不听自己劝说，放走了刘备，还把荆州借给了他，这无疑是放虎归山，养虎为患。刘备不仅借到了荆州，还乘机大幅度拓展了地盘，零陵、桂阳、武陵、长沙四郡也被他收入了版图。想到这些，周瑜寝食不安，十分焦虑。
他让侍者捧出琴，他要借琴消愁。一番“叮咚”调试后，琴声飘然而出：忽而如高山流水，悠扬绵长；忽而如金刀裂帛，激越高亢；忽而如松涛滚潮，闷沉洪远；忽而如百鸟朝凤，穿透云端……琴声变化多端，声声悦耳动听。
只有高手才能弹奏出如此精妙的音律。是的，对音乐的爱好，伴随着周瑜的一生。还在母亲的腹中，他就已经得到了音乐的熏陶，出世后，凭着他对音乐的喜爱，加上母亲的悉心传授，少年周瑜就已经是弹琴的能手了，加上后来专心致志的研究音乐，周瑜成了闻名于世的音乐高手。即使贵为江东的风云人物，在戎马倥偬间，依然得空便抚琴一曲。周瑜对音乐的辨别力，也已深入骨髓，哪怕是酒过三巡，已有微醉，如有人弹琴出错，他必能辨出，并加以指正。时有童谣，曰：“曲有误，周郎顾。”……
周瑜仍然沉浸在如泉水喷涌而出的音乐声中，随着音乐声，周瑜的脑海中浮现出一幕幕场景：三墩屯兵练水军；梅山救女识小乔；道南让宅兄弟情；四城连捷称英豪；赤壁烟火定三分；南郡鏖战箭伤熬；西征受阻进退难；遗恨巴丘志未消……
一阵疼痛，周瑜伤口复发，左手一颤，琴弦断了!琴声戛然而止。
周瑜有不详的预感：此次出征，周瑜是瞒着自己的伤势，装出轻松强健的样子，如常人一般，从而瞒过了孙权，也瞒过了所有人。只有他自己知道，伤口时常作疼。但为了东吴，为了孙氏兄弟的知遇之恩，他只能是鞠躬尽瘁，死而后已了。
他要面见孙权，当面向孙权陈述自己对时局的看法。也想看看小乔和孩子们。
小乔自从嫁给了自己，没有过上一天安宁的日子，一直都是跟随自己鞍马劳顿，颠沛流离。这次西征，她也执意要随军出征。只因刚刚生下了胤儿，身体比较虚弱，就没有让她跟随，要她调养好身体，照顾好三个孩子。长子周循聪明伶俐，女儿活泼可爱，小儿子刚刚出生，还没来得及好好看看，就出征了。真想他们那！
可是，还没到动身就病倒了，周瑜一病不起。
由于箭伤未痊愈，加上鞍马劳顿，又因出征受阻而忧虑，周瑜旧病复发，病得很重。虽有名医精心治疗，病情却一天重似一天。
周瑜也许知道自己过不了这个坎，不久就要撒手而去了。于是，周瑜给孙权写下了遗书。
遗书写道：“瑜本是一个平凡之人，得到先兄和您的重用，视为心腹。我为了报答你们的恩典，效命疆场，不遗余力。不料，在路途染病，虽经治疗，并不见好转。人生有死，我生就短命，诚不足惜。只恨志愿未遂，不能继续为您效命了。”
“当今曹操在北，战事未息；刘备寄寓荆州，有似养虎。天下形势到底如何发展，还不知道。这正是文武大臣废寝忘食，主公日夜焦虑的关键时刻。鲁肃忠贞可靠，办事谨慎，可以代替我的职务。”
“‘人之将死，其言也善。’这些话如有可取之处，我就死而不朽了。”
就这样，周瑜带着他未尽的夙愿，对孙权和江东的依依不舍的情感，对妻子儿女的无限思念而匆匆离去了。年仅三十六岁！
后人曾写诗感叹道：“赤壁遗雄烈，青年有俊声。弦歌知雅意，杯酒谢良朋。曾谒三千斛，常驱十万兵。巴丘终命处，凭吊欲伤情。”
噩耗传出，举国震惊。巴丘军民，万人齐集阅军楼，追悼东吴大都督。
阅军楼西临洞庭，北望长江。“登楼以四望，可以仰三楚长天，揽洞庭秋波，吊汨罗骚魂，抚湘乡斑竹。”
眼下，斑竹泣泪，洞庭缟素，楚天垂云，长江呜咽。人们无心观景，个个怀着沉重的心情，在庄严、肃穆的气氛中，由鲁肃带领全城军民，向周瑜的灵柩三叩首，致以崇敬、缅怀之情。
灵前一副对联，道出了周瑜此生功绩：“披肝沥胆，镇邪除恶；经天纬地，纵横捭阖。浩然正气，光明磊落；功高德重，名垂史册。”
诸葛亮来了，是带着崇敬和遗憾来的。设祭物于灵前，亲自奠酒，长跪于地，悲泣涕零，读祭文曰：“呜呼公瑾，不幸夭亡!修短故天，人岂不伤?我心实痛，酹酒一觞;君其有灵，享我烝尝!吊君幼学，以交伯符;仗义疏财，让舍以民。吊君弱冠，万里鹏抟;定建霸业，割据江南。吊君壮力，远镇巴丘;景升怀虑，讨逆无忧。吊君风度，佳配小乔;汉臣之婿，不愧当朝，吊君气概，谏阻纳质;始不垂翅，终能奋翼。吊君鄱阳，蒋干来说;挥洒自如，雅量高志。吊君弘才，文武筹略;火攻破敌，挽强为弱。想君当年，雄姿英发;哭君早逝，俯地流血。忠义之心，英灵之气;命终三纪，名垂百世，哀君情切，愁肠千结;惟我肝胆，悲无断绝。昊天昏暗，三军怆然;主为哀泣;友为泪涟。亮也不才，丐计求谋;助吴拒曹，辅汉安刘;掎角之援，首尾相俦，若存若亡，何虑何忧?呜呼公瑾!生死永别!朴守其贞，冥冥灭灭，魂如有灵，以鉴我心：从此天下，更无知音!呜呼痛哉!伏惟尚飨。”
庞统来了，五体投地，叩头痛哭：“呜呼哀哉！惊闻公瑾离世，如雷轰顶，统哀痛欲绝。今灵前吊唁，难以言表。统愿扶灵，送公瑾还吴。”
蒋干来了，而且是作为曹操的特使。蒋干跪在周瑜灵前，诵读祭文：“公瑾吾友，仙逝离殇。同窗情谊，永世不忘。夜入江东，游说无功。知尔忠贞，不辞而别。丞相不责，敬佩由衷。赤壁火烧，北军败风。丞相有言，孤败无羞。更服公瑾，旷世英雄。我为特使，吊丧英灵。呜呼哀哉，公瑾寿终。英年早逝，世人心痛。三分天下，九州一统。四海同悲，共祭周公！”
周瑜的灵柩由鲁肃护送回到江东。孙权亲自到芜湖迎接周瑜的灵柩。
孙权扶灵失声痛哭，说道：“公瑾有佐王之才，今忽短命。以后我依靠谁呢？”他亲自为周瑜素服节哀，左右大为感动，并为周瑜举行了国葬，命厚葬于本乡。
周瑜被安葬在了庐江境内（舒城当时被曹操所占）。